个人简介
2007年毕业于扬州大学,获得计算机应用硕士学位,2007年-2011年就职于中科院昆明植物研究所,2011年至今就职于美高梅娱乐城(中国)官方网站 讲师及副教授,2020年-2024年于安徽师范大学攻读生物学博士学位,主要研究方向为生物信息学。
长期从事生物信息学与大数据挖掘工作,主要主持国家自然科学基金1项,省教育厅项目2项,校内教改项目1项,重点实验室课题3项。以第一作者或通讯作者在《Nature Communications》、《Plant Communications》、《BMC Genomics》、《Frontier in Plant Science》、《Forests》、《Scientific Reports》以及《Insects》等期刊发表论文20余篇,同时获得实用新型专利4项,软件著作权9项。指导的学生在省级或国家级计算机竞赛中获奖达10余次。另外曾参与中科院野生稻、茶叶、竹子等多个基因组计划,积累了丰富的生物信息学和生物大数据分析经验。
科研项目
[1]. 国家自然科学基金地区基金,31960142,全球生态环境变化过程中松科物种的适应性进化机制研究,2020.1-2023.12,主持
[2]. 西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室开放课题,KLESWFU-201905,全球气候变化过程中柳属的适应性进化研究,2020.1-2022.12,主持
[3]. 云南省教育厅项目,2015Y287,基于高通量测序的高产脂思茅松分子标记的数据挖掘研究,2015/10-2017/12,主持。
[4]. 云南省生物学优势特色学科开放基金,高产脂思茅松分子标记的数据挖掘研究,2015/03-2016/10,主持。
[5]. 昆明市林业信息工程技术研究中心开放基金,林业生物信息云平台的构建研究,2016/1-2017/12,主持。
[6]. 校教改项目,YB201426,数据库原理与应用课程教学研究,2015/01-2016/12,主持。
[7]. 国家自然科学基金地区项目,61363061、最优化技术在基因组测序模拟及分析中的应用、2014/01-2017/12,参加。
[8]. 国家自然科学基金地区项目,31360067、中国西南地区树属植物分类及谱系地理学研究、2014/01-2017/12,参加。
[9]. 国家自然科学基金地区项目,C160901、钩状木霉与枯草芽孢杆菌对核桃炭疽病的协同生防作用机制研究、2016/01-2019/12,参加。
[10]. 国家自然科学基金地区项目, 31660029,思茅松毛虫肠道微生物群落组成和结构动态变化研究,2017/01-2020/12,参加。
发表文章
[1]. Miao G, Zhao Y*, Wang Y, Yu C, Xiong F, Sun Y, Cao Y. Suitable Habitat Prediction and Analysis of Dendrolimus houi and Its Host Cupressus funebris in the Chinese Region. Forests. 2024; 15(1):162. (SCI 2区,并列第一)
[2]. Mao J, Cao Y, Zhang Y, Huang B, Zhao Y*. A novel method for identifying key genes in macroevolution based on deep learning with attention mechanism. Sci Rep. 2023;13(1):19727 (SCI 2区,通讯作者).
[3]. Zhao Y*, Su C, He B, et al. Dispersal from the Qinghai-Tibet plateau by a high-altitude butterfly is associated with rapid expansion and reorganization of its genome. Nat Commun. 2023;14(1):8190 (SCI 1区,第一作者).
[4]. Zhao Y*, He B, Tao R, Su C, Ma J, Hao J, Yang Q. Phylogeny and Biogeographic History of Parnassius Butterflies (Papilionidae: Parnassiinae) Reveal Their Origin and Deep Diversification in West China. Insects. 2022;13(5):406. (SCI 2区,第一作者)
[5]. Huang B, Liu J, Jiao J, Lu J, Lv D, Mao J, Zhao Y*, Zhang Y. Applications of machine learning in pine nuts classification. Sci Rep. 2022;12(1):8799. (SCI 2区, 通讯作者)
[6]. Yin X*, Yang D*, Zhao Y*, Yang X, Zhou Z, Sun X, Kong X, Li X, Wang G, Duan Y, Yang Y, Yang Y. Differences in pseudogene evolution contributed to the contrasting flavors of turnip and Chiifu, two Brassica rapa subspecies. Plant Commun. 2022 Sep 2:100427. (SCI 1区,并列第一)
[7]. Huang B, Mao J, Zhao Y*, Sun Y, Cao Y, Xiong Z. Similar Pattern of Potential Distribution of Pinus yunnanensis Franch and Tomicusyunnanensis Kirkendall under Climate Change in China. Forests. 2022; 13(9):1379. (SCI 2区,通讯作者)
[8]. Huang B, Mao J, Xiong Z, Zhao Y*. DKIMDB: The gut microbial database of the larvae of Dendrolimus kikuchii Matsumura. In Proceedings of the 2022 4th International Conference on Advances in Computer Technology, Information Science and Communications (CTISC), 2022; pp. 1-5. (EI, 通讯作者)
[9]. Zhao Y* Liu X, Guo R et al.. Comparative genomics and transcriptomics analysis reveals evolution patterns of selection in the Salix phylogeny. BMC Genomics. 2019 Mar 29;20(1):253. (SCI 2区,第一作者)
[10]. Zhao Y*, Han C, Cao Y, Zhou H. Comparative Genome and Transcriptome Analysis Reveals Gene Selection Patterns Along with the Paleo-Climate Change in the Populus Phylogeny. Forests. 2019;10(2). (SCI 2区,第一作者)
[11]. Cao Y, Dai F, Li Y, Jia L, Luan Y, Zhao Y*. The research on the mechanism of Tsoong inhibiting for colon cancer. Saudi Journal of Biological Sciences. 2019;26(3):605-613. (SCI 3区,通讯作者)
[12]. Zhao Y *, Cao Y, Wang J, Xiong Z. Transcriptome sequencing of Pinus kesiya var. langbianensis and comparative analysis in the Pinus phylogeny. BMC Genomics. 2018;19:725 (SCI 2区,第一作者)
[13]. Cao Y, Xiong F, Zhao Y*, et al. Pow law in random symbolic sequences. Digit Scholarsh Humanit. 2017;32(4):733-738. ( SCI 4区,通讯作者)
[14]. Zeng F*, Zhao Y*, Zhang Q, Gao L. LTRtype, an Efficient Tool to Characterize Structurally Complex LTR Retrotransposons and Nested Insertions on Genomes. Front Plant Sci. 2017;8. (SCI 2区,并列第一)
[15]. Zhao Y*, Xiong Z. RNASIM: A Simulation Tool for Transcriptome Sequencing. IEEE ICCC2017. 2017.11(EI,第一作者)
[16]. Cao Y, Zhao Y*, Yue X et al. Between disorder and order: A case study of power law. Phys A Stat Mech its Appl. 2016;456:244–55.( SCI 4区,通讯作者)
[17]. Cao Y, Xiong F, Yue X, and Zhao Y*. Computer Simulations Find the Optimum Combination of Solexa Sequencing Libraries. Journal of Computational and Theoretical Nanoscience. 2015,12(EI,通讯作者)
[18]. Zhao Y*, Xiong F, Zhou K et al. Computer simulation reveals selection of library is related to read length of solexa sequencing in genome projects. 2014 International Conference on Information Science, Electronics and Electrical Engineering. 2014.4(EI,第一作者)
[19]. Zhao Y*, Jiao J, Hu K, Cao Y, Zhou K. Prediction of the optimum combination of solexa sequencing libraries in genome projects. 2012 Systems and Informatics International Conference (ICSAI), 2012:2264 - 2267 (EI,第一作者)
[20]. 赵友杰,张剑峰,曹永忠.基于多层结构模型的生物信息分析平台研究.计算机应用研究.2007, 24(11): 55-59.(核心,第一作者)
[21]. 赵友杰,曹永忠,张剑峰.生物信息学中的数据库技术.生物信息学.2006, 5: 137-139. (核心,第一作者)
[22]. 赵友杰,曹永忠,张剑峰. 基于密度K中心方法的核酸序列聚类.计算机工程.2006,32 (19): 280-282(EI收录,第一作者)